無菌室一般為4 — 5 平方米、高 2.5 米的獨立小房間（與外間隔離），專辟于微生物實驗室內(nèi)，可以用板材和玻璃建造。無菌室外要設(shè)一個緩沖間，錯開門向，以免氣流帶進(jìn)雜菌。

1、樣品的轉(zhuǎn)運(yùn)和人員流動：分配實驗室區(qū)域，首先應(yīng)考慮工作流程、樣品的轉(zhuǎn)運(yùn)和流轉(zhuǎn)、生物安全因素等。

2、靈活性：實驗室設(shè)計能否適應(yīng)未來發(fā)展變化的需要是很重要的。

3、安全性：實驗室的設(shè)計和大小應(yīng)考慮安全性，滿足緊急清除和疏散出口的建筑規(guī)則，針對各實驗室情況配備安全設(shè)備。距危險化學(xué)試劑30米內(nèi)，應(yīng)設(shè)有緊急洗眼處和淋浴室。所有的實驗室和與污染物直接觸的地方均應(yīng)安裝洗手池，將洗手池設(shè)在出口處。洗手池應(yīng)是獨立專用的，不能與污染物處理及實驗混用。

4、設(shè)立煙霧罩和安全設(shè)施：任何安全罩的放置均應(yīng)盡量遠(yuǎn)離出口處，以符合有害實驗遠(yuǎn)離主通道的原則。

5、實驗臺面應(yīng)防水，耐腐蝕、耐熱。實驗室邊臺墻面和教師講臺各配備兩組多功能插座，實驗操作臺采用帶儲物柜式的，臺面設(shè)計藥品架，桌臺設(shè)計應(yīng)考慮方便實驗操作，如桌臺下方略凹能容納坐姿實驗者的雙腿，實驗桌臺每隔1m左右（或者每組實驗臺）設(shè)立兩組多功能插座等。實驗室中的家具應(yīng)牢固，為易于清潔，各種家具和設(shè)備之間應(yīng)保持一定間隙，應(yīng)有專門放置生物學(xué)廢棄物容器的臺（架）。